UCSC Rat Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
RGD Gene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1AldobRGD:2090
    
    
     
0chr5 66,289,668an enzyme exhibiting fructose-bisphosphate aldolase activity, phosphatidylcholine binding, ATPase binding (human ortholog); involved in gluconeogenesis, glycolysis, response to peptide hormone stimulus (insulin, glucagon) and other processes; found in the cytoplasm, rough endoplasmic reticulum, nucleus and other components; associated with Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent; Liver Neoplasms, Esophageal Neoplasms and other diseases; part of the glycolysis pathway, gluconeogenesis pathway (human ortholog)
2AspgRGD:708388
    
    
     
n/achr6 136,919,104displays lysophospholipase, asparaginase and platelet-activating factor acetylhydrolase activities
3AlpiRGD:2099
    
    
     
n/achr9 85,894,620catalyzes the conversion of an orthophosphoric monoester to an alcohol phosphate
4Mylk2RGD:620934
    
    
     
n/achr3 143,258,016kinase; phosphorylates a serine in the N-terminus of a myosin light chain
5HaaoRGD:71071
    
    
     
n/achr6 7,203,904enzyme responsible for the synthesis of quinolinic acid
6LOC680430RGD:1591770
    
    
     
n/achr17 50,339,264n/a
7LctRGD:620823
    
    
     
n/achr13 41,016,851catalyzes the hydrolysis of pyridoxine-5'-beta-D-glucoside to release pyridoxine; also catalyses the hydrolysis of lactose to D-glucose and D-galactose
8GalmRGD:1359459
    
    
     
n/achr6 3,051,421human homolog catalyzes the interconversion of the alpha- and beta-anomeric configurations of hexose sugars including glucose and galactose
9ChrngRGD:2354
    
    
     
n/achr9 86,015,144gamma subunit of a functional nicotinic acetylcholine receptor
10Myo1aRGD:3135
    
    
     
n/achr7 67,707,218myosin isoform that connects actin filaments to the membrane in intestinal microvilli
11Alx1RGD:2273
    
    
     
n/achr7 41,100,381homeodomain transcription factor that may play a role in chondrocyte differentiation
12Olr287RGD:727837
    
    
     
n/achr1 200,002,404member of the olfactory receptor family
13NesRGD:3162
    
    
     
n/achr2 180,056,427intermediate filament protein specifically expressed in neuroepithelial stem cells; may play a role in neural cell differentiation
14F2rl1RGD:620866
    
    
     
n/achr2 25,892,652G-coupled protein receptor that is activated by coagulation factor II and other serine proteases; may play a role in regulation of exocrine secretion
15PdynRGD:62054
    
    
     
n/achr3 117,297,196expression in hippocampus increases in response to traumatic brain injury; may play a role in regulatio of neurotransmitter release
16Pfkfb4RGD:3310
    
    
     
n/achr8 114,031,538has both fructose-2,6-bisphosphate 2-phosphatase and 6-phosphofructo-2-kinase activities; plays a role in fructose 2,6 bisphosphate metabolism and regulation of glycolysis
17Tgm4RGD:620785
    
    
     
n/achr8 127,800,975may act as an androgen-regulated transglutaminase
18Aqp7RGD:2145
    
    
     
n/achr5 58,440,792may play a role in fluid transport and homeostasis during testis development and spermatogenesis
19Slc5a1RGD:3713
    
    
     
n/achr14 83,340,944catalyzes sodium dependent glucose transport; plays a role in sugar absorption in the small intestine and reabsorption of sugars in the kidney
20Cyp4a8RGD:628846
    
    
     
n/achr5 135,562,528monoxygenase found in rat testes
21Tpsb2RGD:3065
    
    
     
n/achr10 14,614,017serine protease; plays a role during the inflammatory process
22Prrx1RGD:628884
    
    
     
n/achr13 78,995,265binds the collagen I alpha 1 and the osteocalcin promoters; acts as a negative regulator of transcription
23GzmbRGD:620018
    
    
     
n/achr15 35,196,790serine proteinase associated with cytotoxic T lymphocytes and NK cell induced apoptosis
24Hrasls5RGD:1308376
    
    
     
n/achr1 210,361,719exhibits acyltransferase activity (inferred)
25Madcam1RGD:3029
    
    
     
n/achr7 11,554,920mediates the rolling and sticking of lymphocytes to the high endothelial venule (HEV) of the Peyers patch
26Olr1397RGD:1334139
    
    
     
n/achr10 34,922,262predicted member of the olfactory receptor family
27Olr1398RGD:735025
    
    
     
n/achr10 34,941,241member of the olfactory receptor family
28Slc29a2RGD:69296
    
    
     
n/achr1 207,647,039nucleoside transporter
29Acy1RGD:2030
    
    
     
n/achr8 111,579,229enzyme that displays aminoacylase and/or metallopeptidase functions; may be involved in amino acid metabolism
30RGD1565493RGD:1565493
    
    
     
n/achr7 71,586,003n/a
31Grin2bRGD:2738
    
    
     
n/achr4 172,952,541encodes a protein exhibiting N-methyl-D-aspartate selective glutamate receptor activity, ionotropic glutamate receptor binding, zinc ion binding and other functions; involved in associative learning, memory, regulation of long-term neuronal synaptic plasticity and other processes; found in N-methyl-D-aspartate selective glutamate receptor complex, synapse, dendritic spine and other components; associated with Diabetes Mellitus, Experimental; Hypoxia-Ischemia, Brain; Trauma, Nervous System and other diseases; associated with abnormal learning/memory, perinatal lethality; part of Reelin signaling pathway, Excitatory synaptic transmission pathway, long term potentiation
32Rps15RGD:62026
    
    
     
n/achr7 10,928,060a component of the ribosome; may be associated with pancreatic beta-cell insulinomas
33RGD1562373RGD:1562373
    
    
     
n/achr8 124,114,681n/a
34Cdcp1RGD:1305578
    
    
     
n/achr8 127,970,238n/a
35Slc2a2RGD:3705
    
    
     
n/achr2 116,051,167acts as a sodium-independent glucose transporter; plays a role in intestinal glucose transport
36Aqp2RGD:2142
    
    
     
n/achr7 138,328,373water channel protein involved in water reabsorption and vasopressin regulation in kidney collecting duct cells; mutation is linked to nephrogenic diabetes insipidous (NDI)
37Tmem101RGD:1306490
    
    
     
n/achr10 91,220,150n/a
38IdeRGD:2861
    
    
     
n/achr1 241,596,960enzyme involved in the degradation of bioactive peptides including insulin, beta-endorphin, atrial natriuretic peptide and beta-amyloid
39Cyp2d2RGD:2471
    
    
     
n/achr7 120,798,244debrisoquine 4-hydroxylase activity
40Pax8RGD:620434
    
    
     
n/achr3 2,699,139acts as a redox regulated transcriptional activator
41AlplRGD:2100
    
    
     
n/achr5 156,530,233catalyzes the conversion of an orthophosphoric monoester to an alcohol phosphate
42Slc21a4RGD:621387
    
    
     
n/achr4 179,574,422plays a role in methotrexate transport; may facilitate basolateral membrane uptake and renal clearance of methotrexate from the blood
43Mettl7bRGD:1305205
    
    
     
n/achr7 2,270,716n/a
44CyssRGD:735160
    
    
     
n/achr3 138,828,794a protein exhibiting cysteine-type endopeptidase inhibitor activity, protease binding; involved in negative regulation of cell proliferation, cell killing, cell development and other processes; found in the extracellular space, secretory granule
45Zp1RGD:620604
    
    
     
n/achr1 213,413,352glycoprotein component of the zona pellucida
46Acrv1RGD:620153
    
    
     
n/achr8 37,940,939human homolog is a testis-specific differentiation antigen; associated with the acrosome of mature sperm and has been targeted for a potential contraceptive vaccine
47Rdh2RGD:735050
    
    
     
n/achr7 67,759,626a short-chain dehydrogenase/reductase that catalyzes the conversion of retinol to retinal, the first step in retinoic acid synthesis
48CubnRGD:68355
    
    
     
n/achr17 87,658,986receptor for intrinsic factor (IF)-cobalamin; involved in vitamin B12 uptake (cyanocobalamin)
49Tmem79RGD:1309886
    
    
     
n/achr2 180,444,453n/a
50Bmp7RGD:620743
    
    
     
n/achr3 163,761,498binds to cell surface heparan sulfate